1:氮磷鉀總含量超過(guò)8%時(shí)，與菌混合會(huì)壓制菌的活性。菌與化肥混合使用時(shí)，要注意肥料中氮、磷、鉀的總養(yǎng)分不能超過(guò)8%。一旦超過(guò)，菌的活性就會(huì)受到壓制。如果氮磷鉀總養(yǎng)分大于8%，建議混合使用。目前一些廠家的復(fù)合微生物肥料中氮、磷、鉀總養(yǎng)分達(dá)到10%以上，有的甚至達(dá)到25%以上，會(huì)降低細(xì)菌的活性，對(duì)一般菌株甚至?xí)斐刹糠炙劳?。但如果廠家選擇耐肥菌株，可以保證菌的肥效。

2:不要將菌肥與殺菌劑、殺蟲(chóng)劑、除草劑、含硫肥料(如硫酸鉀)、稻草灰混合使用。因?yàn)檫@些肥料，很容易消滅生物細(xì)菌?；蛘呦仁┚剩?8小時(shí)后再爭(zhēng)取除草。拌種時(shí)，禁止與已混有殺菌劑的種子混合使用。還應(yīng)防止與未成熟的農(nóng)家肥混合。

3:對(duì)于多年施用化肥的田地，施用生物菌肥時(shí)不能大幅度減少化肥和有機(jī)肥的施用量。因?yàn)檗r(nóng)作物對(duì)化肥的依賴(lài)，用生物菌肥代替化肥一下子適應(yīng)不了。因此，一年、二年和三年，其替代量應(yīng)分別為30%、40%和60%。磷鉀肥只能補(bǔ)，不能減。

4:施用方式上，推薦采用溝施和窩施。菌肥要蓋在土里，避免陽(yáng)光直射，紫外線會(huì)消滅細(xì)菌；另外，不建議沖施微生物肥料，因?yàn)橛盟♂尯蠹?xì)菌會(huì)分散，影響施用后的效果。對(duì)于含硫量較高的土壤和銹跡斑斑的水田，不宜施生物菌肥，因?yàn)榱蚰芟麥缟锛?xì)菌。對(duì)于翻漿的水田，一般不用撒施，但噴霧的效果會(huì)更好。

5:不建議在過(guò)高、過(guò)低和干旱的條件下，不建議對(duì)作物田地施用微生物肥料。